1938年暑期，因海关房屋为航空学校征用，在蒙自的西南联大文法学院师生返回昆明。8月教育部命令增设师范学院，联大校舍困难愈加突出。故购得昆明城西北三分寺附近的荒地124.45亩作为校址地基，并聘请梁思成、林徽因为校舍建筑工程顾问，成立了以黄钰生为主席的校舍委员会，以负责任校舍设计建盖工作。

　　因教工宿舍在9月28日遭日冦轰炸，10月6日，第89次常委会讨论决定，将文法两学院及师范学院之一部（文科）迁移至晋宁盘龙寺，并即在盘龙寺一带筹建全部校舍，以备其他各学院陆续迁往。又与云南省教育厅洽商，借得昆华工业学校校舍为文法学院教室和宿舍；昆华师范的中院、西北院为学生及教职员宿舍；大西门内文林街昆华中学的南院为师范学院教室；北院为师范学院新生及其他各系高年级学生宿舍。至于理学院的教室、实验室及学校各行政部门办公室仍在昆华农业学校，各系一年级学生在该处上课。工学院的教室、宿舍、办公室仍在拓东路迤西会馆、江西会馆及盐行仓库等处。总办公处迁到龙翔街工校。

　　校舍委员会根据教学需要以及现有建筑经费决定建造一些砖木结构的三层房屋。按照计划设计并绘出了图纸。谁料由于战争影响，昆明物价疯涨，原设计难以实现，最后确定除图书馆和两座食堂因面积较大，仍保留砖木结构瓦房外，其余一律是土坯墙、铁皮顶的平房。在施工过程中，白铁皮难以齐全，同时建筑经费缺失，学生宿舍只得改用茅草作顶。

　　1939年4月校舍建筑竣工，下半年即交付使用。这些房屋被称为新校舍。建在昆明环城马路两侧，占地120余亩。

　　马路北面称北区，占地较广，校门为两扇木质大门，门楣上方是镌有“国立西南联合大学”字样的横额。土路把北区划成东西两部分。东半部较大，教室、各部门办公室、图书馆和东西食堂集中；西半部是学生宿舍和运动场。各行政部门的办公室在图书馆东南的土墙平房里。图书馆的北面有两座砖木结构的食堂，同图书馆构成“品”字形。北区的西部是学生宿舍，共有茅屋36座（东西走向的12座，南北向的24座。在一次轰炸中，1、2、28、32号4座茅屋宿舍被炸毁，1、2号未再恢复，28、32号复建）。宿舍区的南端是运动场，有两个篮球场和一些简单的体育运动设备。南区是理学院各学系的办公室、实验室，有一些教室。

　　南区东部是校医室，有门诊部、药房和简易病房，免费为师生诊病。校医室后面的花圃，是生物学系的实验园地。

　　1944年4月第295次常委会讨论通过，将办公室屋顶的白铁皮400余张，转让给重庆建中实业公司，得款200余万元，除去购买茅草作屋顶的费用，余下的正好弥补学校预算的赤字。此后，新校舍除了图书馆和东西两食堂是瓦屋外，只有教室留下了铁皮屋顶，学生宿舍、各类办公室全为茅草屋。下图中即西南联大当时建设新校区校舍旧影几张：

　　1945年12月1日，“一二·一”运动爆发，于再、潘琰、李鲁连、张华昌四烈士惨遭特务杀害，昆明各界进步人士为他们修建了庄严的烈士墓，1946年3月，墓地落成，与此同时，二座石雕火炬纪念石柱也同时建成，矗立于四烈士墓正前方。石柱分顶部火焰、柱体、基座三部分。通高3.3米。顶部火焰高0.5米；柱体为圆柱体，高1.95米，直径0.55米；基座截面为正方形，长、宽均为0.75米，高0.85米，基座四周刻有闻一多先生撰写的《“一二·一”运动始末记》一文，是记载“一二·一”运动的重要历史见证。下图即该石柱旧照与近照：

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